L’anàlisi massiva de dades permet predir millor la resposta del tractament amb immunoteràpia

Un estudi liderat pels programes de Recerca en Informàtica Biomèdica (GRIB) i de Càncer de l'Institut de Recerca de l'Hospital del Mar amb la col·laboració de la Universitat Pompeu Fabra (UPF) ha identificat marcadors predictors de la resposta al tractament amb immunoteràpia -un conjunt de tractaments que estimulen les defenses naturals del cos per a combatre una malaltia- a partir de l'anàlisi de dades de més de 700 pacients procedents de sis cohorts diferents. 

L'estudi, que s'ha publicat a Nature Communications, busca ser especialment útil per a pacients amb càncer de bufeta amb l'ús d'eines d'aprenentatge automàtic per identificar variables clau per a l'èxit del tractament amb immunoteràpia. Aquesta metodologia ha permès identificar els subtipus de tumor que responen millor al tractament amb immunoteràpia.

Els resultats de l'estudi, que també es podrien aplicar a altres tipus de càncer, indiquen que, dels cinc subtipus de tumors en aquest càncer, el que millor resposta té davant aquest abordatge és el més rar, el subtipus neuronal. 

La resta presenta una taxa de resposta més baixa. Així, en un subgrup de pacients amb càncer de bufeta avançat s'ha vist que els marcadors descrits fins ara funcionen bé per predir la resposta al tractament, mentre en la resta "depèn d'altres factors biològics", un camp en què els autors de l'informe apunten que s'hauria de continuar investigant.

La intel·ligència artificial, clau

El treball ha desenvolupat un algoritme d'aprenentatge automàtic per predir la resposta al tractament en aquests pacients amb subtipus de tumor diversos. Segons els resultats de l'estudi, els marcadors que millor indiquen si el tractament tindrà èxit són la càrrega mutacional tumoral (el nombre de mutacions del tumor), les mutacions introduïdes pels enzims de la família APOBEC vinculades amb l'heterogeneïtat tumoral i l'abundància de macròfags, cèl·lules del sistema immunitari, proinflamatòries.

Al mateix temps, l'estudi ha identificat marcadors en el microambient al voltant del tumor que impedeixen que el tractament funcioni. A banda d’aquests marcadors coneguts, l'anàlisi ha identificat un tipus de mutacions rares que podrien provocar la presentació de nous fragments de proteïnes a la superfície del tumor, fent-les així visibles al sistema immunitari. D'aquesta manera, s'ha constatat que la infiltració de cèl·lules immunitàries en el tumor "és important", però "no és l'únic indicador de resposta al tractament ni ho és per a tots els pacients".